Postdoc in infectieziektemodellering

Intro

Ben jij een datawetenschapper of wiskundig modelleur met een passie voor infectieziekte-epidemiologie en volksgezondheid? Enthousiast over onderzoek in epidemiologie, geneeskunde en datawetenschap? Sluit je aan bij ons team in een ambitieus project dat infectieziektebestrijding kan transformeren!

Wat ga je doen?

Als Postdoc Infectieziektemodellering speel je een sleutelrol bij het aanpassen en valideren van een agent-gebaseerd model om infectieziektedynamieken beter te begrijpen en te voorspellen. Je krijgt de kans om te werken op het snijvlak van epidemiologie, klinische geneeskunde en datawetenschap, waarbij je gebruikmaakt van een van de meest uitgebreide gezondheids- en demografische gegevensbronnen in Nederland.

Je zult:

• Een agent-gebaseerd model valideren en verfijnen voor de verspreiding van infectieziekten in Amsterdam met behulp van retrospectieve en actuele klinische, demografische en pathogeen gegevens.
• Samenwerken met een multidisciplinair team van epidemiologen, datawetenschappers en zorgprofessionals om complexe datasets te integreren.
• Het model gebruiken om transmissiehotspots te identificeren, risicopopulaties te voorspellen, de ziektelast te voorspellen en verschillende uitbraakscenario's te simuleren.
• Protocollen ontwerpen en implementeren om ziekenhuisgebaseerde elektronische patiëntendossiers (EPIC) en laboratoriuminformatiesystemen (LIMS) te koppelen aan demografische gegevens met hoge resolutie van het CBS (Centraal Bureau voor de Statistiek).
• Werkstromen ontwikkelen en itereren voor de continue integratie van databronnen om realtime modelupdates te waarborgen.
• Bevindingen communiceren aan stakeholders en strategische besluitvorming voor infectieziektebestrijding ondersteunen.

Wat neem je mee?

Belangrijke kwalificaties en vereiste vaardigheden:

• PhD in infectieziektemodellering, biomathematica, biostatistiek, computationele biologie of een andere relevante kwantitatieve achtergrond.
• Sterke programmeervaardigheden (Python, R en/of C/C++).
• Ervaring met ODE/PDE, stochastische processen en/of agent-gebaseerde modellering.
• Ervaring met het werken met grootschalige datasets, data-integratie en databeheer.
• Sterke analytische en probleemoplossende vaardigheden, met het vermogen om complexe gegevens om te zetten in bruikbare inzichten.
• Uitstekende communicatie- en samenwerkingsvaardigheden.

Verder breng je bij voorkeur de volgende ervaring en kennis mee:

• Expertise in respiratoire infectieziekten en modellering.
• Ervaring met agent-gebaseerde modellering in infectieziekte-epidemiologie.
• Achtergrond in public health of health data-science.
• Kennis van pathogeen surveillance en het Nederlandse volksgezondheidssysteem en databeheerregelgeving (ervaring met CBS is een pluspunt).

Wat bieden we jou?

• Een vliegende start van jouw carrière in het onderzoekswerk.
• Alle ruimte voor jouw drive om de zorg van morgen vorm te geven.
• Werken aan grootschalig én eigen onderzoek, met gemotiveerde collega’s uit alle hoeken van de wereld.
• De mogelijkheid om te werken aan een project met een hoge impact dat geavanceerde modellering combineert met toepassingen in de praktijk voor epidemische respons.
• Je treedt in dienst bij Amsterdam UMC Research BV.
• Een contract voor 12 maanden (verlenging mogelijk, mits hier financiële middelen voor zijn).
• Inschaling in salarisschaal 10: € 3.493 tot € 5.504 bruto bij een fulltime dienstverband (afhankelijk van opleiding en ervaring) en een eindejaarsuitkering van 8,3%. Bereken hier jouw netto salaris.
• Vakantie uren: 186,4 uur per jaar bij een fulltime dienstverband en een mogelijkheid om uren bij te sparen.
• Pensioenopbouw bij BeFrank, een modern, begrijpelijk en eerlijk geprijsd pensioen.
• Bij 7 km of meer (enkele reis) 100% OV-vergoeding en bij eigen vervoer €0,18 per km tot maximaal 40 km enkele reis.
• Kom je liever lopend of op de fiets? Maak gebruik van onze goede fietsregeling. Je ontvangt een vergoeding à €0,18 per km.

Bekijk deze video met meer informatie over de indiensttreding bij Amsterdam UMC Research BV.

Waar ga je werken?

Amsterdam UMC Research BV ondersteunt wetenschappelijk onderzoek zonder winstoogmerk. Hiermee voorzien we onderzoekers in alles wat ze nodig hebben om te kunnen excelleren. Zo bieden onze principal investigators (PI's) en projectleiders begeleiding op het gebied van projectbeheer, finance en human resources. Bij medisch-wetenschappelijke onderzoeksprojecten wordt daarnaast ook ondersteuning op juridisch vlak geboden.

Bekijk de video voor meer informatie.

Je komt te werken in een dynamische en samenwerkende werkomgeving met toonaangevende volksgezondheids- en academische instellingen in Amsterdam, waaronder het Laboratorium voor Toegepaste Evolutionaire Biologie (LAEB) aan het Amsterdam UMC onder leiding van Professor Colin Russell (Link). Bij LAEB werk je met een internationaal divers team van computationele en experimentele biologen die werken op het snijvlak van evolutie, epidemiologie en pathogene biologie.

Wat ga je onderzoeken?

Het GRIFFINS Project is een gezamenlijk initiatief van GGD Amsterdam, Amsterdam UMC, afdeling Medische Microbiologie en Infectiepreventie, en het Amsterdam Health & Technology Institute (AHTI). Dit éénjarige project heeft als doel het ontwikkelen van een dynamisch en responsief surveillance framework door het integreren van demografische gegevens op hoge resolutie, klinische en diagnostische informatie van ziekenhuizen, pathogeen data en epidemiologische gegevens. Met behulp van deze gegevensbronnen zal je een voorspellend agent-gebaseerd model aanpassen en valideren om de verspreiding en impact van infectieziekten te simuleren, transmissiehotspots te identificeren en volksgezondheidsinterventies te informeren. Het GRIFFINS-kader voorziet in de behoefte aan een samenhangende, realtime en datagestuurde aanpak van infectieziektebestrijding en paraatheid.

Tijdens de publicatieperiode worden aanvragen continu behandeld. Als de vacature vervuld is, wordt deze vroegtijdig gesloten.

Wij streven naar een startdatum van 1 januari 2025. 

Heb je nog vragen? Voor inhoudelijke informatie over deze vacature kun je terecht bij Dr. Jelle Koopsen, Postdoc onderzoeker bij de GGD Amsterdam, via 020-5553821 of jkoopsen@ggd.amsterdam.nl.  

Voor meer informatie over de sollicitatieprocedure kun je terecht bij Rhiannon Sandfort, Recruitment adviseur, via r.e.sandfort@amsterdamumc.nl. 

Een referentiecheck en screening kunnen onderdeel zijn van de procedure. Kom je bij ons in dienst, dan vragen we voor een aantal functiegroepen standaard een VOG (Verklaring Omtrent Gedrag). Lees hier wat dit inhoudt en of het voor jouw functie van toepassing is.

Interne kandidaten krijgen, bij gelijke geschiktheid, voorrang op externe kandidaten.

Acquisitie naar aanleiding van deze vacature wordt niet op prijs gesteld.